Le Dépôt de fret de Halmahera était un grand dépôt logistique de l’intendance. Ses missions comprenaient notamment le stockage des vivres ainsi que l’approvisionnement et la gestion des armes et munitions, des uniformes, des médicaments et du matériel courant. Le dépôt réceptionnait les cargaisons arrivant par navire pour les redistribuer vers les divisions et garnisons isolées.

Le dépôt est créé en 1943, lorsque l’état-major japonais décide de transformer Halmahera, dans les Indes néerlandaises (aujourd’hui en Indonésie) en l’une de ses principales bases logistiques du Pacifique Sud-Ouest. Cette décision intervient après les revers subis à Guadalcanal et en Nouvelle-Guinée.

La 2ème Armée de zone, commandée par le général Korechika Anami, installe progressivement son réseau logistique à Halmahera, qui occupe une position stratégique. Depuis cette île, les convois peuvent ravitailler la Nouvelle-Guinée occidentale, les Moluques, Céram, les Célèbes, Timor et les garnisons des petites îles environnantes.

En 1944, Halmahera devient le principal centre de distribution japonais dans cette partie des Indes néerlandaises. Il reçoit les cargaisons venant principalement du Japon, de Formose (Taïwan), des Philippines et de Singapour.

Le dépôt comprend notamment des entrepôts, des quais de débarquement, des parcs automobiles et des ateliers de réparation. Il compte plusieurs centaines d’hommes composé de personnels de l’intendance, de magasiniers, de comptables militaires, de chauffeurs, de manutentionnaires, de spécialistes des transports maritimes, de cuisiniers et d’ouvriers chargés de l’entretien des entrepôts.

À partir de la mi-1944, la situation devient très difficile. Les sous-marins américains et l’aviation alliée détruisent une grande partie du trafic maritime japonais, ce qui provoque des pénuries alimentaires et des ruptures d’approvisionnement. Le dépôt continue néanmoins à fonctionner jusqu’à la fin de la Seconde Guerre mondiale, en gérant les stocks restants et en redistribuant les ressources disponibles aux unités encore présentes.

Après la capitulation du Japon en août 1945, les personnels du dépôt restent sur place plusieurs mois. Ils participent à la remise des stocks aux forces alliées et assistent le rapatriement progressif des soldats japonais. Le dépôt est officiellement dissous lors du rapatriement des troupes entre 1945 et 1946.